基于转录组学和生物信息学的高海拔肺动脉高压大鼠模型的新靶点

肝动脉热力（PH）是指血清素时平均肝动脉压≥25 mmHg。 它根据血流力学时特征、发病必要和病理学时包含五类。 第三类低纬度肝动脉热力（HAPH）是由于在低纬度诱发周围环境中的肝换气量代偿性增加和肝小动脉肠胃引起的，导致高原心肌病。 医学腹泻还包括灵活性呼吸困难、头痛和疲倦。 HAPH 不太可能反映了未有适应低纬度，并伴有不清楚的病理生理必要。 大约有 1.4 亿人贫困在海拨 2,500 米以上的南部，每年有超过 4,000 所到之处访问这些低纬度南部。 诱发导致肾脏遗传物质传达曲谱时有发生关联变化； 这就是指长期住在在低纬度南部的本地人及其先祖的遗传物质型适应性变化中的知悉的。HAPH 的治疗法仍在研究工作中的。应建议患者移至较低海拨南部，氧疗有效。制剂治疗法的研究工作仅限于一些随机试验。 HAPH 的病理与其他类型的 PH 并不互为同，因此有一点权衡对 PAH 有效的制剂前提对 HAPH 有效。

然而，所有这些小分子制剂都在HAPH中的的实证和必要尚不清楚。为了补救这个问题，我们旨在研究工作诱发所互为关的分子可必要，可用灵长类动物 HAPH 数学时模型，并应用综合三三组学时方法。 在此反复中的，我们旨在研究工作几种小分子制剂和复氧的起到，以互为符低纬度引起的诱发的潜在新治疗法靶点。 有一点注意是，我们研究工作了小分子制剂如何因素肾脏间的关联遗传物质和蛋白质传达。

研究工作结构设计：

将灵长类动物置于 10% O2（诱发）室中的 3 年后激发 PH。对照灵长类动物（C 三组）在整个试验中的中的都处于常氧周围环境下，并在治疗法过后（即从第 21 天开始）用小分子来进行治疗法。 3周时，其余灵长类动物随机包含六三组；一三组被斩首（第 21 天）以评估心脏功能。其余 5 三组用小分子制剂或复氧治疗法，从第 21 天到第 35 天斩首。慢性诱发，小分子补救问题（M）；慢性诱发，司来帕格治疗法；慢性诱发，佩蒂特替坦治疗法；慢性诱发，riociguat 治疗法；慢性诱发、复氧 (RE)。

激活三组统计分析：

提取总 RNA，并通过可用 Arraystar rRNA Removal Kit 去除 rRNA 来富集 mRNA 和非UTF- RNA。 mRNA 和非UTF- RNA 被短片化蛋白酶分解成短短片（~200-500 nt）。以短短片为模板，透过随机六聚体多肽裂解第一肽键cDNA。在第二肽键裂解反复中的，dTTP 被 dUTP 过渡到。 然后转入除去蛋白酶以通过外侧修复和添加甘氨酸来转化和转化短短片。 短短片被转化并与接头互为互连接； 可用尿嘧啶-N-糖基化酶消化第二条肽键。 琼脂糖凝胶电泳后，选择适合于的短片作为模板来进行PCR扩增。 可用 Agilent 2100 生物统计分析仪和 ABI StepOnePlus 实时 PCR 系统对样品库来进行一原理和能量密度评估。 该文库可用 Illumina HiSeq 2000 系统来进行基因三组。

LC-MS/MS 统计分析

在互为互连接到 Easy-nLC 1000 液互为色曲谱系统的Q Exactive HF 质曲谱仪上统计分析样品。将干燥的肽样品之后混合物在甲苯 A（0.1% 甲酸水溶液）中的并加载到捕集柱中的可用甲苯 A 的小得多压力为 280 bar，然后在自制的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的梯度来进行转化流动互为 B（甲醇和 0.1% 甲酸），水量为 600 nl/min，停滞 150 分钟。 QE HF 的 MS 统计分析是在 3e6 离子的自动增益控制目标下来进行一次全图像，然后来进行多达 30 次与数据特别的 MS/MS 图像具有极高能量的撞击解离，在 Orbitrap 中的检测到（R = 15,000 在 200 m/z）。

研究工作结果：

基于RNA-seq数据的共传达网络的功能富集统计分析和交通中的心分子可认定。

基于蛋白质数据的共传达网络的功能富集统计分析和交通中的心分子可认定。

RNA-seq 和CDC时了解到了对三种制剂的反应间的弱特别性，具有几乎并不互为同的效果。GO 富集显示关联传达的遗传物质还包括参与代谢调节、激活和转译的遗传物质。

司来帕格、佩蒂特替坦和复氧可提升 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被认定出来，通过三三组学时择优，作为参与HAPH的不可或缺遗传物质。这些发现为 HAPH 的小分子制剂必要给予了新的论点。

研究工作正确性：

Selexipag、macitentan 和复氧显着消散了灵长类动物 HAPH 数学时模型，而 riociguat 的起到占优势。 关联传达的遗传物质参与代谢调节、激活和转译。 某些蛋白质受到 HAPH 和治疗法的因素。 我们可用三三组学时方法择优了不可或缺遗传物质 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些发现不太可能有助于较好地了解诱发所互为关的分子可必要，并不太可能给予新的治疗法靶点。

典籍引自：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.